Το Εργαστήριο Φυσικών επιστημών έχει εξοπλιστεί επαρκώς για την εκτέλεση πειραμάτων Φυσικής Χημείας και Βιολογίας. Διαθέτει εννέα πάγκους εργασίας και μπορεί να φιλοξενήσει 27 μαθητές και μαθήτριες. Διαθέτει Ηλεκτρονικό υπολογιστή και σύστημα βιντεοπροβολέα.